اسید سیتریک یک افزودنی پرکاربرد در صنایع غذایی است که به‌عنوان تنظیم‌کننده pH و نگهدارنده استفاده می‌شود. بااین‌حال، در مقادیر بالا یا با خلوص پایین ممکن است اثرات منفی بر سیستم گوارش، از جمله تحریک مخاط معده، ایجاد کند. بهبود فرآیند تولید اسید سیتریک می‌تواند از بروز این مشکلات جلوگیری کند.
برای کاهش اثرات جانبی، استفاده از روش‌های پیشرفته تصفیه مانند کروماتوگرافی و فیلتراسیون غشایی برای حذف ناخالصی‌ها در مرحله خالص‌سازی ضروری است. همچنین کنترل دقیق pH در مراحل تولید و تنظیم میزان اسید باقی‌مانده در محصولات نهایی، می‌تواند اثرات تحریک‌کنندگی را کاهش دهد.
علاوه بر این، جایگزینی روش‌های شیمیایی با فرآیندهای زیستی پیشرفته که از میکروارگانیسم‌های اصلاح‌شده ژنتیکی استفاده می‌کنند، منجر به تولید محصولاتی با خلوص بالاتر و سازگاری بیشتر با سیستم گوارشی می‌شود. استانداردسازی مقدار مجاز اسید سیتریک در محصولات غذایی نیز نقش مهمی در پیشگیری از آسیب‌های گوارشی دارد.